Seperti rumah kapsul, yang sesungguhnya adalah gorong-gorong raksasa berdiameter 2 meter. Ini menjadi bilik-bilik tempat tidur para santri.
Ada pula rumah berbentuk segitiga yang terbuat dari kayu jati dan multipleks.
Selain itu, terdapat rumah joglo, di halaman pun terdapat perahu dengan panjang sekitar lima meter. Serta juga ada gubuk-gubuk seperti rumah honai.
Tempat tinggal para santri dan ustaz serta ustazah ini dibedakan menjadi tiga klaster, yakni terdiri dari gorong-gorong, rumah kepang, dan rumah sesek. Setiap hunian bisa ditinggali 2-8 orang sesuai klasternya.
Pesantren didesain sedemikian rupa, tentu memiliki tujuan khusus yakni agar anak-anak merasa tidak sedang tidur di pesantren, justru malah seperti di tempat wisata dengan spot-spot yang unik.
Namun di Planet Nufo juga terdapat sebuah gedung, yang hanya untuk memenuhi kebutuhan administratif saja.
Kegiatan belajar mengajar biasanya dilakukan di berbagai tempat sesuai keinginan murid dan guru.
Planet Nufo memiliki lahan sekitar 5 hektare yang bisa dimanfaatkan para santri murid Planet Nufo untuk menunjang seluruh aktivitas mereka, baik belajar maupun latihan berwirausaha, khususnya dalam bidang pertanian dan peternakan.
Dengan lahan yang luas ini, memungkinkan mereka melakukan aktivitas belajar-mengajar langsung di alam semesta.
Tak terbatas pada membaca dan merenung di ruangan yang terbatasi tembok, tetapi juga melakukan pengamatan serta penelitian di lapangan.
Planet Nufo memiliki nilai plus yaitu memiliki tenaga pengajar orang-orang muda pilihan berpendidikan master dan doktor, bahkan ada pula yang lulusan luar negeri.
Tak hanya itu, Nufo pun memiliki program menghafalkan Al-Qur'an.
Sekolah Alam Planet Nufo mengarahkan semua warganya untuk menghafalkan Al-Qur'an. Sebab, hafal Al-Qur’an adalah jalan yang sangat strategis untuk menjadi ilmuwan dan profesional yang bervisi transformasi Islam di masa depan.
Planet Nufo juga menjadikan penguasaan kitab kuning sebagai basis.
Seorang Muslim tidak mungkin bisa memahami Islam dengan baik jika tidak menguasai bahasa Arab.
